הכליות הן איבר חיוני לניקוי הדם ולסילוק פסולת שתן מהגוף. מלבד זאת יש לכליה גם תפקידים חשובים אחרים כמו שמירה על הומיאוסטזיס בגוף דרך השפעה על לחץ דם, הפרשת הורמונים, איזוני חומצה ובסיס וריכוז האלקטרוליטים בגוף.
יחד עם הריאות, הכליות הן האיברים העיקריים לוויסות רמת החומציות (pH) בגוף. הם עושים זאת על ידי ספיחת ביקרבונט מהשתן והפרשת יוני מימן. הכליות משתמשות באנזים קרבוניק אנהידראז כדי לזרז תגובות המערבות ביקרבונט.
הכליה היא איבר הומאוסטטי גם ביחד לאלקטרוליטים. חלק מהאלקטרוליטים שהכליה עוזרת לשמור בהומאוסטזיס הם נתרן, אשלגן, כלוריד, ביקרבונט, מגנזיום, נחושת ופוספט.
הכליות אינן קשורות ישירות לרמות לחץ הדם בגוף, אך הן פועלות לוויסות שלו בטווח הארוך. הן עושות זאת באמצעות המווסתת את כמות הנוזלים בתאי הגוף ואת רמות הנתרן בפלסמה של הדם.
הכליה מפרישה שני הורמונים חשובים שעוזרים לתמוך בהומאוסטזיס – אריטרופואטין ורנין. אריתרופויאטין ממריץ את הייצור של תאי דם אדומים במח העצם. זה קורה בתגובה לשיעורי התחלופה הרגילים (תוחלת החיים) של תאים אלה ובמקרים בהם רקמות לא מקבלות מספיק חמצן.